مجتبی عمادی بایگی

دانشیار

ژنتیک

دانشکده علوم پایه

تلفن: 038-32324419

emadi-m@sci.sku.ac.ir

دفتر کار مجازی

زمینه های تحقیقاتی
   زیست شناسی سامانه ای بر پايه داده های چندگان شناسی: کشف پیچیدگی‌های مولکولی بیماری‌های انسانی، به‌ویژه سرطان، از طریق تجزیه و تحلیل جامع چندگان شناسی در هر دو سطح توده و تک ياخته. هدف ما شناسایی نشانگرهای زیستی جدید، اهداف درمانی و مدل‌های پیش‌بینی‌کننده برای بهبود تشخیص و درمان هدفمند است.
   بررسي صفات انساني مبتني بر رويه هاي ژنتيكي و/يا بيوانفورماتيكي و/يا سامانه هاي زيستي: با عنايت به رهيافت هاي مبتني بر سامانه هاي زيستي و محاسباتي مي توان صفات انساني را از ابعاد جديدي مورد مطالعه قرار داد كه به خصوص مي تواند در شناخت بيماري هاي مختلف منجمله سرطان و لذا يافتن رويه هاي پيشگيري/درماني جديد موثر باشد.



سوابق تحصیلی
   دکتری، زیست‌شناسی (تمام گرایشها)، دانشگاه تربیت مدرس، ایران ، تاريخ فارغ التحصيلی: ١٣٨٨
   کارشناسی ارشد، مدیریت (تمام گرایشها)، ، ایران ، تاريخ فارغ التحصيلی: ١٣٩٨
   کارشناسی ارشد، زیست‌شناسی (تمام گرایشها)، دانشگاه تربیت مدرس، ایران ، تاريخ فارغ التحصيلی: ١٣٨٢
   کارشناسی ، زیست‌شناسی (تمام گرایشها)، دانشگاه فردوسی مشهد ، ایران ، تاريخ فارغ التحصيلی: ١٣٨٠

مقالات
International Journal
1. Saba Hatefi-Shogae, Modjtaba Emadi-Baygi, Rasoul Ghaedi-Heydari, Analysis of Human Papillomavirus-Associated Cervical Cancer Differentially Expressed Genes and Identification of Prognostic Factors using Integrated Bioinformatics Approaches , Advanced Biomedical Research 13 (1), 78
2. Anis Khalafiyan, Modjtaba Emadi-Baygi, Markus Wolfien, Ali Salehzadeh-Yazdi, Parvaneh Nikpour, Construction of a three-component regulatory network of transcribed ultraconserved regions for the identification of prognostic biomarkers in gastric cancer , Volume124, Issue3, March 2023, Pages 396-408
3. Mahmood Borzouei, Mohammad Mardaani, Modjtaba Emadi-Baygi & Hassan Rabani , Development of a coupled modeling for tumor growth, angiogenesis, oxygen delivery, and phenotypic heterogeneity , Biomechanics and Modeling in Mechanobiology volume 22, pages1067–1081 (2023)
4. Modjtaba Emadi-Baygi1*, Mahsa Ehsanifard1†, Najmeh Afrashtehpour1†, Mahnaz Norouzi2† and Zahra Joz-Abbasalian3, Corona Virus Disease 2019 (COVID-19) as a System-Level Infectious Disease With Distinct Sex Disparities , Front. Immunol., 29 November 2021 Sec. Systems Immunology
5. Pejman Salahshouri, Modjtaba Emadi-Baygi, Mahdi Jalili, Faiz M Khan, Olaf Wolkenhauer, Ali Salehzadeh-Yazdi, A Metabolic Model of Intestinal Secretions: The Link between Human Microbiota and Colorectal Cancer Progression , Metabolites 2021, 11(7), 456; https://doi.org/10.3390/metabo11070456
6. Fatemeh Mansouri‐Movahed Fatemeh Akhoundi Parvaneh Nikpour Masoud Garshasbi Modjtaba Emadi‐Baygi, Identification of a novel HEXB Mutation in an Iranian Family with suspected patient to GM2-gangliosidoses , Clinical Case Reports; 2020
7. Azadeh Rahimi, Rina Sedighi, Modjtaba Emadi‐Baygi, Mohammad‐Amin Honardoost, Seyed‐Javad Mowla, Hossein Khanahmad, Parvaneh Nikpour, Bioinformatics prediction and experimental validation of a novel microRNA: hsa‐miR‐B43 within human CDH4 gene with a potential metastasis‐related function in breast cancer , J Cell Biochem. 2020 Feb;121(2):1307-1316.
8. Marzieh Gerami, Mohammad Eshghi, Modjtaba Emadi‑Baygi, Fatemeh Elahian, Mehdi Hosseinzadeh, A biological multiplexer, designs, and simulations , JOURNAL OF SUPERCOMPUTING; 2020
9. Soheili N, Eshghi M, Emadi-Baygi M, Mirzaei SA, Heidari R, Hosseinzadeh M., Design and evaluation of biological gate circuits and their therapeutic applications in a model of multidrug resistant cancers , Biotechnol Lett. 2020 Aug;42(8):1419-1429.
10. Emadi E, Akhoundi F, Kalantar SM, Emadi-Baygi M. , Predicting the most deleterious missense nsSNPs of the protein isoforms of the human HLA-G gene and in silico evaluation of their structural and functional consequences , BMC Genet. 2020 Aug 31;21(1):94.
١١. مجتبی عمادی، سید جواد مولی، پروانه نیک پور، تقی طریحی, بیان متمایز دو واریانت مختلف Survivin در طی تکوین مغز موش , یاخته
12. سید جواد مولی، مجتبی عمادی، امیر محسن ضیایی، پروانه نیک پور, Evaluating Expression and Potential Diagnostic and Prognostic Values of Survivin in Bladder Tumors: A Preliminary Report , Urology Journal
13. سید جواد مولی، مجتبی عمادی، امیر محسن ضیایی، یاسر اطلسی، پروانه نیک پور, Evaluation of sensitivity and specificity of urine survivin as a new molecular marker in diagnosis of bladder tumors , IRANIAN JOURNAL of BIOTECHNOLOGY
14. مجتبی عمادی، زهرا سهیلی، اینگو اشمیتز، شهرام سمیعی، ولفگانگ شولز, Snail regulates cell survival and inhibits cellular senescence in human metastatic prostate cancer cell lines , Cell Biol Toxicol
15. مجتبی عمادی، زهرا سهیلی، فرانک اسمان، عبدالخالق دیزجی، رلینر اینگرس، ولفگانگ گورینگ، ولفگانگ شولز, Slug/SNAI2 regulates cell proliferation and invasiveness of metastatic prostate cancer cell lines , Tumor Biol.
16. مجتبی عمادی، پروانه نیک پور، الهه عمادی, SIX1 overexpression in diffuse-type and grade III of gastric tumours, the features that associated poor prognosis , Advanced Biomedical Research
17. شیما رحمتی، مجتبی عمادی، پروانه نیک پور، الهه عمادی, Expression profile of ZFX isoform3/variant 5 in gastric cancer tissues and its association with tumor size , The Iranian Journal of Basic Medical Sciences
18. پروانه نیک پور، مجتبی عمادی، کریستین اشتاینهوف، کریستیانه هادر، آنا لوکا، سید جواد مولی، ولفگانگ شولز, The RNA binding protein Musashi1 regulates apoptosis, gene expression and stress granule formation in urothelial carcinoma cells , Journal of cellular and molecular medicine
19. پروانه نیک پور، هاجر میران زاده، مجتبی عمادی، رویا کلیشادی, Association of rs8066560 variant in the sterol regulatory element-binding protein 1 (SREBP-1) and miR-33b genes with hyperglycemia and insulin resistance , Journal of Pediatric Endocrinology and Metabolism
20. غزاله فاطمی، مجتبی عمادی، پروانه نیک پور، رویا کلیشادی، مهین هاشمی پور, Abscence of association between-1131T> C polymorphism in the apolipoprotein APOA5 gene and pediatric metabolic syndrome , Iranian Journal of Pediatrics
21. پروانه نیک پور، مجتبی عمادی، الهه عمادی، شیما رحمتی, EYA1 expression in gastric carcinoma and its association with clinicopathological characteristics: a pilot study , Medical Oncology
22. مهناز نیک پور، مجتبی عمادی، یوتا فیشر، گونتر نیگیش، ولفگانگ شولز، پروانه نیک پور, MTDH/AEG-1 contributes to central features of the neoplastic phenotype in bladder cancer , Urologic Oncology
23. الهه عمادی، پروانه نیک پور، مجتبی عمادی، علی بیدمشکی پور, Association of HOTAIR expression in gastric carcinoma with invasion and distant metastasis , Advanced Biomedical Research
24. ندا مستوفی زاده، پروانه نیک پو.ر، شقایق حق جوی، ، مجتبی عمادی، هاجر میران زاده، سیلوا هوسپیان، مهین هاشمی پور, The G395R Mutation of the Sodium/Iodide Symporter (NIS) Gene in Patients with Dyshormonogenetic Congenital Hypothyroidism , International journal of preventive medicine
25. مطهره هاشمی، کامران قائدی، احمد سلامیان، خدیجه کربلایی، مجتبی عمادی، سمیه تنهایی، محمد حسین نصر، حسین بهاروند, Fndc5 knockdown significantly decreased neural differentiation rate of mouse embryonic stem cells , Neuroscience
26. مجتبی عمادی، پروانه نیک پور، فائزه محمد هاشم، محمد رضا مراثی, شقایق حق جوی, MSI2 expression is decreased in grade II of gastric carcinoma , Pathology-Research and Practic
27. پروانه نیک پور، مجتبی عمادی، فائزه محمد هاشم، محمد رضا مراثی, شقایق حق جوی, MSI1 overexpression in diffuse type of gastric cancer , Pathology-Research and Practice
28. پروانه نیک پور، مجتبی عمادی, Deregulation of MTDH gene expression in gastric cancer , ASIAN PAC J CANCER P
29. پروانه نیک پور، مجتبی عمادی، فائزه محمد هاشم، محمد رضا مراثی, شقایق حق جوی, Differential expression of ZFX gene in gastric cancer , J. Biosci.
Research Journal
30. Mina Dehghani-Samani, Mojtaba Emadi Baygi , Weighted Gene Co-expression Network Analysis Unveiled Key Genes Related to Progression and Prognosis of Cervical Cancer , Journal of Genetic Resources, 2023; 9(1): 92-102.
٣١. مهدیه میرعلی ملک , شیما رحمتی , مجتبی عمادی بایگی , افسانه ملک‌پور , حسین تیموری , بیان ژن Env در زنان مبتال به سرطان پستان در استانهای چهارمحال و بختیاری و اصفهان , مجله دانشکده پزشکی اصفهان، دوره 38، شماره 600: هفته چهارم دی ماه 1399 : 849-855
32. Mozhdeh Riahi and Modjtaba Emadi-Baygi, Evaluating Functional and Structural Consequences of the most Deleterious Single Nucleotide Polymorphisms of Human CXC Motif Chemokine 10 (CXCL10) Using in silico Analyses , J Genet Resour 7(2): 227-245. doi: 10.22080/jgr.2021.21373.1252
33. Hasan Rahimi-Tamandegani, Parvaneh Nikpour, Mojtaba Emadi Baygi, Evaluation of long non-coding RNAs: HNF1A-AS1 and MVIH expressions and their clinical significance in human gastric cancer , Journal of Genetic Resources 6 (1), 60-68
٣٤. مجتبی عمادی، زهرا سهیلی، شهرام سمیعی, بررسی بیان ژنهای Snail در سرطان پروستات , فصلنامه فیض
٣٥. فائزه محمد هاشم، پروانه نیک پور، مجتبی عمادی, ارزیابی و بهینه سازی روش های مختلف استخراج RNA از بافت های منجمد انسانی , مجله دانشکده پزشکی اصفهان



کتب و جزوات
١. مجتبي عمادي بايگي، سعيد افشار و دکتر مجيد صادقي زاده، مقدمه ای بر ژنتيک پایه، 1381، انتشارات سنجش، 328 ص



افتخارات



پایان نامه ها
ردیف نام دانشجو عنوان تاریخ دفاع
١. صادق ابراهیمی بررسی بیان و عملکرد ژن TWIST1 در پوش چنگارهای شایع بر اساس رویکرد های درون تراشه ای سه شنبه ٢٠ شهريور ١٤٠٣
٢. مریم کلانتری بررسی بیان و عملکرد ژن SNAI۱ در کارسینوماهای شایع بر اساس طراحی آ زمایش های خشک دوشنبه ٢٠ شهريور ١٤٠٢
٣. نجمه افراشته پور بررسی نحوه‌ی تکامل کلونال سرطان روده‌ی بزرگ در بافتار میکروبیوم سه شنبه ١٥ شهريور ١٤٠١
٤. بررسی دینامیکی تهاجم سلولهای سرطانیِ مبتنی بر EMT با استفاده از شبکه ناهمگن فضایی - زمانی پنج شنبه ٢٨ اسفند ١٣٩٩
٥. بررسی شبکه هم بیانی ژنی در شناسایی ژنهای متاستاز مرتبط با سرطان دهانه رحم پنج شنبه ٣٠ بهمن ١٣٩٩
٦. بررسی اثر متقابل میکروبیوم و سلولهای سرطانی کلورکتال با استفاده از مدلسازی متابولیکی در مقیاس ژنوم دوشنبه ٣١ شهريور ١٣٩٩






کلیه حقوق سایت برای دانشگاه شهرکرد محفوظ است