دانشگاه شهرکرد با موافقت دفتر گسترش آموزش عالی وزارت علوم، پذیرش دانشجوی کارشناسی علوم و مهندسی محیط زیست را از بهمن ماه 1395 آغاز نمود. این دانشگاه در شهریور ماه 1399 موفق به اخذ مجوز لازم برای پذیرش دانشجوی کارشناسی ارشد در رشته علوم و مهندسی محیط‌ زیست- گرایش مدیریت و حفاظت تنوع زیستی شد و از مهرماه 1399 نسبت به پذیرش دانشجو در مقطع کارشناسی ارشد اقدام نموده است. گروه آموزشی مهندسی محیط زیست هم‌ اکنون با تعداد چهار نفر عضو هیات‌ علمی تمام‌وقت فعالیت می‌کند.