دانشکده کشاورزی که با هدف تأمین نیروی انسانی متخصص و کارآمد در رشته‌های مختلف کشاورزی در سال 1369 (1990میلادی)   تأسیس شده، قدیمی‌ترین و به نوعی هسته‌ی اول تشکیل دانشگاه شهرکرد است که دارای امکانات آموزشی  شامل آزمایشگاه‌های مختلف، سایت کامپیوتر و سایت GIS ،گلخانه، واحد دامپروری‌ است. از سال 1372 به تدریج رشته های کارشناسی ناپیوسته مهندسی تولیدات گیاهی، مهندسی تولیدات دامی،‌ مهندسی آبیاری و مهندسی ماشینهای کشاورزی و کارشناسی پیوسته مهندسی خاکشناسی در این دانشکده دایر گردید.

در سال 1378 در مقطع کارشناسی پیوسته مهندسی ماشینهای کشاورزی و در سال 1379 در مقطع کارشناسی ارشد اصلاح نباتات پذیرش دانشجو صورت گرفته است. دانشکده کشاورزی قدیمی ترین دانشکده در دانشگاه محسوب شده که با هدف تأمین نیروی انسانی متخصص و کارآمد در رشته های مختلف کشاورزی تأسیس شده است.

این دانشکده در حال حاضر در مقطع کارشناسی ارشد در 7 رشته و  16 گرایش ، در مقطع دکتری در9 رشته و 26 گرایش و در مقطع كارشناسي در 7 رشته دانشجو می پذیرد. دانشکده کشاورزی در حال حاضر دارای ۷۲ عضو هیأت علمی شامل 21 استادیار، 34 دانشیار و ۱7 استاد تمام و با بیش از ۱۵۰۰ دانشجو در مقاطع کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری تخصصی است.

دانشکده کشاورزی دارای ۱۵ آزمایشگاه مختلف و یک آزمایشگاه تحقیقاتی می باشد

دانشکده کشاورزی دارای 15 آزمایشگاه مختلف و یک آزمایشگاه تحقیقاتی می باشد.

آزمایشگاه تحقیقاتی با هدف سرویس دهی به کلیه گروههای آموزشی دانشکده از وسایل مجهز و پیشرفته کلیه گروهها تشکیل شده و در حال حاضر آزمایشات متعددی در این بخش انجام می‌گردد.

مقاطع و گرایش های تحصیلی دانشکده كشاورزي به شرح زیر می باشد.

ماموریت و اهداف دانشکده کشاورزی :

ماموریت دانشکده  کشاورزی  دانشگاه شهرکرد حصول اطمینان  از  آموزش دانشگاهی مستمر و با کیفیت بالا و آموزش مستمر مادام العمر با هدف  ترویج کشاورزی ، پایداری

زیست محیطی، اجتماعی و از طریق پژوهش، آموزش، و مشارکت عمومی و تاثیر آن بر کیفیت زندگی

اهداف دانشکده کشاورزی  :

• ت,سعه و هماهنگی  در راستای بهبود کیفیت آموزش با توجه به نیاز های کشور در آموزش های تکمیلی  در حوزه   کشاورزی پایدار و سیستم های غذایی

​

• استفاده از برنامه های تحقیق و توسعه جمهوری اسلامی ایران  در راستای توسعه حوزه های تحقیقاتی در  حوزه کشاورزی پایدار و سیستم های غذایی

​

• زمینه سازی برای  همکاری بین المللی با دانشکده ها و مراکز تحقیقاتی در منطقه و بین الملل  در راستای تبادل  تبادل دانشجو و فرصت های مطالعاتی  

​

•    انجام تحقیقات مربوط به کشاورزی پایدار و ارائه طرق حل مشکلات با توجه به تحقیقات و بررسیهای بعمل آمده

​

• برگزاری همایش های علمی ، ملی ، منطقه ای و بین المللی در  حوزه های علمی و پژوهشی در حوزه کشاورزی پایدار  .

​

• انجام فعالیت های پژوهشی با همکاری مراکز علمی و پژوهشی در راستای بهبود، ارتقاء و به روز نمودن آزمون های تشخیصی در کشور و خارج از ایران

​

• همکاری با مراکز و موسسات آموزشی و تحقیقاتی در اجرای طرح ها و پروژه های پژوهشی بین‌المللی.

​

• پرورش و تامین نیروی انسانی لازم در کشاورزی، محیط زیست  توسعه پایدار